3.魏、晋、隋、唐时期：

魏晋至隋唐的七百余年间，北方少数民族不断入侵中原，致使北方战争频繁，南方则相对安定。因而北方士民大量南迁，吴氏宗族也在南迁之列。据唐林宝撰写的《元和姓纂》记载，这期间的吴氏大族主要分布在吴郡、武昌、濮阳、渤海、陈留等地，并呈南兴北衰之势。

自吴允承回迁吴郡奉祀先祖吴太伯三代之后，历史进入了三国时期，吴氏家族成为割据江东的孙吴政治的国戚，孙策、孙权兄弟的母亲吴国太便源于吴郡吴氏。

据《江阴吴氏统宗源流考》记载，吴允承之子奉祀侯吴妁早逝，留下两子两女。长子吴熊庆继承父业，留居吴郡。次子吴景和两个姐姐南下钱塘(今浙江杭州)投奔亲戚。吴氏姐弟少年寄人篱下，历经生活艰辛之苦。吴氏两姐妹由于源于名门之后，如花似玉，德才兼备，远近闻名。

吴郡富春人(今浙江富阳)孙坚当时才二十岁，在当地做官，很有势力。他慕名前去求婚，吴家亲戚嫌孙坚粗鲁、狡诈，不答应这门亲事。孙坚遭到拒绝后既羞惭又气恼，他扬言要报复。吴景的大姐姐怕连累亲戚就劝说：“不要因为我一人而拖累大家，如果那人不好，就怪我命运不好吧。”这样吴家大女儿就嫁给了孙坚，史称吴皇后，后来她的妹妹做了孙坚之妾。谁料孙坚日后竟发达起来，后官至破虏将军，领豫州牧，成了东汉末年的一大军事割据势力。吴夫人先后为孙坚生了四个儿子：孙策、孙权、孙翊、孙匡，妹妹为其生了孙朗、孙仁两兄妹。孙权则继承父兄打下的基业，成了一代帝王，建立了东吴政权，与魏、蜀鼎分天下。公元202年吴夫人去世，与丈夫孙坚合葬于高陵(今江苏丹阳)，后尊为武烈皇后。

吴景，少时与两个姐姐相依为命，因而深得孙策、孙权兄弟的敬重，他官至丹阳太守，封扬武将军，为孙吴政权屡建战功。吴景去世后，其长子吴奋继续被孙权重用，封为吴郡都督，统兵镇守东方，后封为新亭侯。吴奋逝世后，其子吴安袭爵，吴安之时，孙权三子孙和被立为太子，四子孙霸封为鲁王，他与太子争宠。吴安和东吴一些大臣依附鲁王孙霸，图谋杀害太子。事情败露后，吴安随鲁王孙霸一同被孙权赐死，吴景长子一支至此绝传。吴景次子吴祺被孙权封为都亭侯，逝世后，子吴纂袭封，吴纂娶东汉都亭侯滕胤之女为妻。孙权逝世时遗命滕胤、诸葛恪辅佐幼主，吴纂岳父成了东吴顾命大臣。后来孙坚之弟孙静的曾孙孙峻、孙琳兄弟弄权，杀害了滕胤、诸葛恪，诬陷其谋反。吴纂一家受株连而遇害。至此吴郡吴氏只剩下吴妁长子吴熊庆这一支了。

吴熊庆自幼聪明过人，被时人誉为神童。吴妁逝世后，吴熊庆即以长子身份留居吴郡，顶立吴氏门户。孙权称帝后，尊封大舅吴熊庆为太傅、吴郡公。这支吴氏在东吴四代被封侯，以国戚、先贤后裔风光于世，直到公元280年东吴灭亡，吴熊庆四世孙嗣贤侯吴之则遇害，这支吴氏才退隐于民间。半个世纪后，东晋王朝建立，江浙一带又成为统治中心。公元323年晋明帝追封古先贤后裔，吴之则之孙吴皋益被封为昭衍公，这支吴氏又重新肇显于世