所有这些抗清活动，集中发生在顺治二年到七年、八年之间。总的看，他们的活动还是很分散的，没有形成集中统一的力量。然而，从他们所控制的广大地区和掌握的强大的军事力量来看，清统治集团已深深地感到严重威胁，这关系到清能否长久立足中原。形势还是相当复杂而严峻的。特别是长江以南，东南沿海，以及西到四川，这一广大地区仍然控制在南明或农民起义军手中，直接影响到全国的形势动荡不定。面对这一危险的局势，摄政的多尔衮是无法乐观的。如何稳定形势，尽快夺取未占领的地区，歼灭各个抗清的武装力量，是摆在首要地位的头等大事。多尔衮没有别的选择，只能靠军事手段，才能最终实现一统天下的宏伟的政治目标。从顺治二年下半年开始，多尔衮不断选将命帅，派出一支支部队，攻取未占领的地区，并到各出事地区，扫荡一切敢于反抗清政权的军事与政治势力：

顺治二年十一月，以驻西安的内大臣何洛会为“定西大将军”，会同右翼固山额真墨尔根侍卫李国翰等进军四川，征剿张献忠的农民军。《清世祖实录》，卷21，8页。

年底，以贝勒勒克德深为“平南大将军”率师向湖广进兵。

三年正月，以和硕肃亲王豪格为“靖远大将军”率师进川，合剿张献忠。《清世祖实录》，卷23，9页。

二月，任命多罗贝勒博洛为“征南大将军”率师征福建、浙江。《清世祖实录》，卷24，16页。

四月，多尔衮以皇帝的名义，通知兵部：命令恭顺王孔有德、怀顺王耿仲明、智顺王尚可喜、续顺公沈志祥各统所部骑兵，于五月初一日先赶到北京，其步兵可派委官率领，也同时启程，随后至京。《清世祖实录》，卷25，14页。没有说明调动意图，但孔有德等人也明白，把兵马调进京，必有出征之举。

五月，得到蒙古苏尼特部落腾机思等王公贵族叛乱，率部叛逃喀尔喀（外蒙），即命和硕德豫亲王多铎为“扬威大将军”，同多罗承泽郡王硕塞等，统率大军征讨。《清世祖实录》，卷26，2页。

八月，正式下达命令委任孔有德为“平南大将军”，会同耿仲明、沈志祥等率满蒙汉八旗兵往征湖广（湖南）、两广（广东、广西）。《清世祖实录》，卷27，21页。数日后，又令尚可喜率部赴孔有德军，协征湖广等地。《清世祖实录》，卷27，22页。

顺治五年（1648年）二月，原明降将江西总兵金声桓据南昌叛清。三月，命固山额真谭泰为“征南大将军”，统兵赴江西平叛。《清世祖实录》，卷37，18~19页。

……

满洲、蒙古、汉军八旗将士相继出征，投入新的战斗。孔、耿、尚“三顺王”与续顺公沈志祥已经率部进关，奉命南征。只有吴三桂尚未得到应征的命令。不过，他从朝廷一系列的调兵特别是孔、耿、尚也被调走来判断，他已感到自己在锦州的日子不会很长了。果如所料，顺治五年初，朝廷向他下达了携家西征的命令。他立即回报启程赴京的日期。接着，二月十五日，他又向朝廷写了一份奏折，请示他走后家事如何处理。他写道：

本藩（吴自称）奉命西迁，已将起行日期奏报外，但本藩生于辽，长于辽，有祖父坟园葬立中后（所），叨蒙皇恩特赐葬祭。今本藩领全家及官兵全家往西剿抚，本藩思源之念虽殷，不敢私自留人看守。中后原有本藩安设庄田拾处，今留人丁百余，并本藩兄吴三凤、部劄游击张羽高督率看守，以备祭扫。恳祈皇上、皇叔父摄政王洪慈，俯勅户部，准给原设庄田留人看守坟园，即本藩之祖父得沾圣恩于九泉，本藩矢忠之心得图报于万一矣。《明清史料》丙编第7本，658页。

从这份奏折，我们知道，不仅他死去的父母、弟弟已受到优恤，而且他的祖父也给予“特赐葬祭”。以往凡有所请，朝廷无不恩准。这次要求留下哥哥吴三凤和一名游击将官督率百余人看守庄田，祭扫祖坟，朝廷不会有异议。为了免除他的后顾之忧，安心西征，主持朝政的多尔衮自然是满口应承的。三桂的要求得到了满足，便迅速料理好家事，整治行装，携带家眷，率骑兵先行进京，步兵随后进发。