吴姓迁入安溪后，随着历史进展，人口增长，后裔也不断从肇基地分支移居县内外繁衍，目前定居于安溪的族系有：　
　　(一)吴源荣--吴喜支系　
　　吴源荣于宋开宝年间(968～975年)迁入安溪吴埔(今凤城吾都)后，生五子，长居养、次居聚、三居道、四居益、五居方。次子居聚生两子，长子喜，次子盾。宋乾兴元年(1022年)，吴喜迁德化九蔡(今有济)。喜生子名聪，聪生子慧，慧生三子：长名理、次名道、三名明。理生子鼎茂(讳仁)，鼎茂于元末分居安溪常乐里剑斗大溪洋尾，传三子：长顺斋，字子元，居剑斗五羚；次敬斋，字子和，移居磐山(今感德镇潘田)；三子敏斋，字子惠，移居感德镇石门。　
　　1. 感德磐山吴氏　　
　　明洪武十四年(1381年)，吴喜的六世孙吴敬斋，因避水患，从剑斗移居磐山(今感德潘田)，成为磐山吴氏始祖。现有祖祠“兰谷堂”与“磐谷堂”。磐山吴氏后裔繁多，并衍播到感德镇洪佑、炉地、福德、大坂、大格、华地及桃舟乡下格等村。　
　　2. 感德石门吴氏　　
　　明洪武二十一年(1388年)，吴喜的六世孙吴敏斋因避洪水，从剑斗移居石门，兴建中兴祖祠，迄今繁衍二十六世。　
　　3. 感德福德吴氏　　
　　明嘉靖二年(1523年)，感德磐山吴敬斋的次子吴国睿(号居竹，吴喜的七世孙)从潘田移居福德。　
　　4. 感德龙通吴氏　　
　　明嘉靖年间(1522～1566年)，吴敏斋之裔吴伯异，由石门迁入定居。　
　　(二)吴源荣--吴盾支系　
　　吴盾乃吴源荣之孙，吴喜之弟。北宋乾兴元年(1022年)与吴喜同时离开吴埔(今凤城镇吾都村)。吴盾迁还集里岭后(今长坑乡三村)。子孙先后播迁到祥华乡祥地、西坪镇阳星、尚卿乡银场、魁斗镇半仑、龙涓乡厚田、石塔、湖陵、圣草池及桃舟乡桃舟、莲地等地。称为岭后吴氏(“岭后”之名源自其先祖居住地泉州清源山麓朋山之岭后)。　
　　1. 长坑三村吴氏　
　　吴盾的四世孙吴隐(字淑云)仍居长坑乡三村村岭后，其十六世孙吴孝本、吴孝亲、吴孝君分派长坑乡三村村的后墘、石皆头、密洋、庵边自然村和长坑乡文坪村文德垵的长科坪，感德镇石阶头。长坑乡三村村吴氏后裔还先后移居沙县、顺昌、浦城，江西上饶、玉山、广丰、铅山及浙江开化、常山、温州等地。　
　　2. 祥华祥地吴氏　
　　吴盾的四世孙吴哲(字伯明，吴隐胞弟)入住多卿(今祥华乡美西)坑内美仓厝。明隆庆年间(1567～1572年)，吴哲的十六世孙吴绶(字宦达，号传三)从多卿迁入金田乡还一里上第坊洋中堡(今祥华乡祥地村)肇基。祥华乡祥地村吴氏从清乾隆年间(1736～1795年)以来有族人移居台湾及江西永丰、兴国、大余等县，省内的顺昌、南平、永安、漳平、沙县、漳州芗城、龙海角尾、厦门、同安马巷、泉州城内、永春、南安、惠安等地。　
　　3. 西坪阳星吴氏　
　　明嘉靖年间(1522～1566年)，吴哲的十七世孙吴镗(号逊谦)由多卿山紫厚移基西坪镇阳星村。　
　　4. 尚卿福林银场吴氏　
　　明嘉靖年间(1522～1566年)，吴哲的十七世孙吴琏(又名吴辇，与吴镗兄弟)由多卿山紫厚迁入尚卿福林银场。　
　　5. 魁斗半仑吴氏　
　　明弘治年间(1488～1505年)，吴哲的十五世孙吴时琛从多卿迁入庞州(即蓬州)赤鸟濑(今魁斗溪东村半仑)。　
　　6. 龙涓厚田吴氏　
　　元末，吴哲的十三世孙吴惟和(讳詹)，从同安垵柄返故土，至龙涓圭产。明洪武十四年(1381年)立籍龙涓湄上垵柄。吴惟和的九世孙吴朱锜(字尊奉，号兆万)于明崇祯年间(1628～1644年)开基厚田，为厚田吴氏一世祖。　
　　7. 龙涓石塔吴氏　
　　元末，吴哲的十三世孙吴功仲(又名公重)从祥华多卿山紫厚迁入肇基。　
　　8. 龙涓湖陵吴氏　
　　明代，吴功仲的四世孙吴佛生(1404年生，居次)从龙涓石塔迁入湖陵肇基。　
　　9. 龙涓新岭圣草池吴氏　
　　明代，吴功仲的四世孙吴秉良(1414年生，居五)，从龙涓石塔迁居新岭圣草池肇基。　
　　(三)吴福仁支系　
　　1. 祥华华地吴氏　
　　明洪武十七年(1384年)，吴图元二十世孙吴福仁之子吴仲选、吴仲淛由漳平溪南枣桥移居安溪华地(今祥华乡祥华村)。　
　　2. 蓬莱福山吴氏　
　　元末明初，吴福仁的六世孙吴坤盛自华地移居蓝田后葛。其长子吴祖发(讳福，号温泉)又自蓝田移居善坛郭山(又称谷山，今蓬莱镇福山村)肇基。　
　　3. 蓬莱延寿院吴氏　
　　清乾隆五十年(1785年)，福山吴氏分支迁入蓬莱镇蓬星村延寿院。　
　　4. 金谷金东吴氏　
　　明弘治年间(1488～1505年)，蓬莱福山吴祖发的长子吴毅斋(讳生仔)，自福山迁入溪东谷口乡(今金谷镇金东村)，择卧牛福地建厝定居，为金谷金东吴氏始祖。民国19年(1930年)，后裔一支迁入蓬莱镇美滨村洋中。金谷镇吴氏从五世起就有人移居马来西亚、新加坡、台湾、金门。　
　　(四)吴纯童支系　　
　　明洪武二十一年(1388年)，吴祭的十七世孙吴纯童(字乾瑞，号钝庵)由莆田被聘入安溪当塾师，后定居在坊里(今县城)北门外，肇基魁田堂，后裔称“魁田吴氏”。　
　　1. 凤城魁田吴氏　　
　　吴纯童定居安溪县城后，生三子，长子宝，字昺哲，号静学；次子敦，字荣礼，号静默；三子孳，字敏学；分为大宗长房、大宗二房、大宗三房。子孙繁盛，主要聚居在县城大东街、后北街、小东街、南街、南门等地。并逐渐形成十大房派，即巷尾派、凤坂派、霞仕派、宫边派、对面园派、钱江派、百美派、近祠派、钱溪派和东皋派。后裔在清雍正至咸丰年间(1723～1861年)先后迁往台湾淡水等地，共35批，计100多人；也有迁往福鼎、永春及浙江省。　
　　2. 龙门光孝吴氏　　
　　约于明宣德年间(1426～1435年)，吴纯童的第三子吴孳(字敏学)由县城魁田堂移居依仁里光孝乡(今龙门镇光孝村)肇基。　
　　3. 尚卿福林魁田吴氏　　
　　明成化年间(1465～1487年)，吴纯童的长子吴宝的长孙吴宾(字昭伦，号勤斋)、次孙吴机(字昭侃)由县城魁田堂移居兴一里福竹林乡(今尚卿乡福林村)。福林村另有一支吴姓，系与西坪阳星同时由祥华多卿迁入。　
　　此外，凤城镇上山村小岭、魁斗镇佛仔格村、湖头镇下东居委会、金谷镇尚芸村、参内乡洋乌内村、蓬莱镇美滨村、芦田镇石盘村等地均有魁田吴氏后裔迁入繁衍。　
　　(五)其他支系　
　　1. 城厢东青吴氏　　
　　明洪武元年(1368年)，吴府豆由浙江温州平阳县迁入安溪，后裔世居城厢东青(今城厢雅兴村)，现东青吴氏人口逾千人，均为二世吴忠仁、吴渊寿后裔。　
　　2. 剑斗厚安吴氏　
　　剑斗厚安吴氏始祖吴子原，约于明永乐八年(1410年)前后，偕弟吴子珍避倭寇或当军务外出，吴子原先在剑斗东洋村山美崎落户邱仁甫为婿，后迁入剑斗村溪仔坂，肇基厚安祠。吴子原连续三代单传，至第四代有裔孙四人，长房吴祖隆，号顺斋，居剑斗，后裔主要聚居于今后井村、圳下村及剑斗村部分；二房吴祖瑛，号素庵，迁浙江；三房吴祖应，迁江西；四房吴祖居，号朴轩，居剑斗，后裔主要聚居在剑斗村、圳下村的汤内坂。吴子原后裔子孙兴盛，其中剑斗村吴氏分布于溪仔坂、洋尾、小庵、大畲、溪坂头；后井村分布后井、蔡坑、石古庵、湖坵、坂后洋；圳下村分布于汤内坂、圳下。总人口逾万人。　
　　剑斗除了厚安子原吴氏支系外，现还有“朱厝吴”、“后厝吴”两个支系(来源失考)，人口共100余人。　
　　3. 城厢墩坂吴氏　　
　　安溪墩坂吴氏分为顶墩(含美田)、下墩派与坂顶派。顶墩、下墩派始祖系南安苍山吴启衷的五世孙吴钦明、吴钦玉兄弟，于明成化年间(1465~1487年)迁入。坂顶派系吴启衷的十一世孙吴世美后裔(东房)及西房吴祖降、吴藕才、吴祖广、吴祖谦与十四孙吴武聘等迁入。　
　　后裔迁居城厢镇石古村、南英村、玉田村等地，历史上不乏到台湾及南洋群岛谋生的先人。　
　　4. 感德尾厝吴氏　
　　尾厝村的吴氏于明万历十三年(1585年)由龙岩迁入安溪感德里仙聚坊新田坪肇基。吴伯清、吴伯阳兄弟被尊为尾厝吴氏一世祖。　
　　5. 凤城东门外吴氏　
　　明崇祯年间(1628～1644年)，吴会修(讳复进，号奠容)由石狮龟湖后垵迁入安溪长泰里田底乡(今参内乡田底村)，后择居在坊里东门外(今凤城镇先声居委会)，被尊为一世祖，迄今已传十六世。溯其先祖五处士为石狮龟湖后垵始祖，从莆田平海迁入。凤城镇东门外金山吴氏还于清雍正年间(1723～1735年)自第六世绳字辈起，就有族人陆续迁往马来西亚槟榔屿与台湾等地。其中，雍正、乾隆年间迁往台湾漳化、金门谋生的有吴绳五、吴皇锦、吴皇吉、吴皇孟、吴皇雅、吴皇承、吴皇旺、吴武举；往槟榔屿经商的有吴绳居、吴皇郁、吴皇成、吴皇鼎、吴祖提、吴祖岳、吴祖为、吴祖昔等人。省内迁居同安等地。　
　　6. 金谷山岭吴氏　
　　明洪武四年(1371年)，吴继梁自龙岩黄石迁入，已传十七世。