为提高莫洛的地位，有利于统辖各个方面，号令专一，特加莫洛武英殿大学士，仍以刑部尚书管兵部尚书事，兼都察院右副都御史，兼任陕西经略，赐以敕印。《平定三逆方略》，卷8，13页。

陕西本来有封疆大员，圣祖却又置一经略，位在总督之上。实际上，圣祖是把莫洛当做他个人的代表派到陕西，行使着朝廷所赋予的最大的权力。这表明，圣祖是多么重视陕西的防务！

尽管辅臣父子向朝廷表明态度，同三桂划清界限，未必能赢得圣祖的完全信任。因为他知道辅臣与三桂有过密的关系，他确信这种关系不会一下子断绝。圣祖对辅臣不那么放心，这从他的军事部署和具体任命可以反映出来。

这是同年七月初的事。圣祖单独给甘肃提督张勇发了一道指示：“秦省边陲重地，恐奸宄窃发，尔乃封疆大臣，朕所简任，可率所部总兵等官，固守地方，有为乱者，严行辑治，以副朕倚任股肱之意。”《清圣祖实录》，卷48，18页。张勇任甘肃提督，却让他关注陕西方面的情势，密授以方略，严防逆乱发生。尤其强调张勇是他亲自选任的，以示恩于他，表明皇帝对他的特殊信任。

对张勇如此，相反，对辅臣却想法把他调离陕西。在对张勇发出上述密旨之前，圣祖已命令辅臣同将军席卜臣等赴荆州增援。后因情况有变，指示辅臣不必再去荆州，或者随将军赫叶等进取四川保宁，或仍驻平凉，具体由莫洛酌遣。莫洛回奏，说四川“逆贼”正固守保宁，而广元所属百丈关诸处，有“贼众盘踞”，前往增援的兵力不足，拟将增援的副都统吴国正和马一宝的军队发往广元（今仍名）。《清圣祖实录》，卷48，12页。

这时，突然发生了新的情况：叛军分三路来犯，已包围了宁羌州（陕西宁强）。此处属陕西，为清军入川的后路，圣祖命令莫洛“速行救援”。《清圣祖实录》，卷50，6页。正在保宁的莫洛得到命令，即速传令有关将领赴援。先在宁羌州城外击败叛军，迫使他们撤围而逃。考虑到宁羌地关重要，圣祖及时改变时辅臣的命令，通知莫洛，调遣副将雷继宗与辅臣部固守宁羌诸处。《清圣祖实录》，卷50，8页。就这样，辅臣没有去平凉，而到宁羌州驻守下来。

经略莫洛率师进征四川，在陕西汉中与四川保宁交界的地区受阻：四川叛军又攻占了七盘关与朝天关（两关在广元与宁羌州之间），切断了清军的饷道，驻广元的清援军已缺饷两个月，屯聚在略阳（今仍名）嘉陵江上的粮船被叛军夺去。粮饷不继，清军无法向前推进，而且已处于很危险的境地。圣祖急令：“定西大将军”贝勒董额、经略莫洛、四川总督周有德、巡抚张德地速撤保宁清军，回师广元。要莫洛等人亲自殿后，以利原驻广元的清军安全回汉中，固守阳平（宁羌西北，略阳南）等处，歼除宁羌地区的叛军，“整顿士马，再图恢复”《清圣祖实录》，卷50，11页。。

康熙十三年十二月初，莫洛率部至宁羌州，驻南教场，与辅臣兵营相距二里许。初四日，辅臣标兵突然向莫洛营发起进攻，愤怒呼喊，要粮饷，要好马，蜂拥而来。莫洛猝不及防，他的亲随满兵拼力抵抗，以雨点般的箭矢将乱兵射退。于是，辅臣亲自督战，再次猛冲，矢齐发。莫洛也出，挥兵反击。一颗鸟枪流弹飞来，正命中莫洛，当即身死。莫洛所部章京、笔帖式及兵士多死于乱阵之中。《八旗通志·莫洛传》（初集），卷158。3975页。

战斗结束后，莫洛的标兵和运粮兵还有两千余人，均被辅臣收降。七日，辅臣率叛兵自宁羌州撤至沔县（今陕西勉县西侧）。莫洛余部两千余人不愿参加叛乱，纷纷逃窜，所剩无几。辅臣感到势孤，便从沔县北上略阳驻守。《清圣祖实录》，卷51，19页。定西大将军董额随莫洛之后，撤至沔县，才得知辅臣叛变，急忙退保汉中，迅速向朝廷奏报。他此时还不知道莫洛死活下落，至于辅臣为何叛变，他也一无所知《清圣祖实录》，卷51，7页。。

王辅臣叛变，大概是圣祖没有想到的事吧！消息一传来，他十分震惊。他无法想像，前不久辅臣还揭发了三桂的煽诱，逮住其使者，遣其子入京报告，如今其子还在京师，那么，辅臣为何突然叛朝廷呢？虽然已很快得知莫洛已死及辅臣兵变经过，至于兵变的内幕，他尚不知。圣祖急忙召见辅臣的儿子王继贞，一则告诉其父谋反的消息，一则想从他那里得到点信息。圣祖劈头就是一句：“你父亲反了！”继贞尚能镇静，也许他还没有反应过来，便回答：“我一点也不知道。”圣祖就把陕西方面的奏报出示给他，继贞神情突变，吓得浑身战栗，口噤不能言。圣祖从容地说：“你不要害怕，朕知你父忠贞，决不至于做出谋反的事。大概是经略莫洛不善于调解和抚慰，才有平凉兵哗变，胁迫你父不得不从叛。你马上就回去，宣布朕的命令，你父无罪，杀经略莫洛，罪在众人。你父应竭力约束部下，破贼立功，朕赦免一切罪过，决不食言！”《广阳杂记》，卷4，186页。