三桂得知杨素蕴弹劾他，深为恼火，立即上疏反驳，摘录其中“防微杜渐”等词语，“请旨诘问”杨素蕴，作出解释。杨素蕴遵旨回奏：“臣官御使时，见平西王吴三桂题补方面官，不论内外远近，一例坐缺定衔，有碍国体，是以具疏驳正，至于防微杜渐等语，原属概论古今通义，未尝专指该藩。臣与该藩素不识面，有何嫌隙？不过据理而陈，非别有意见。”《清圣祖实录》，卷5，12页，参见《逆臣传·吴三桂传》，卷1，11页。虽然说得有理，朝廷不敢开罪吴三桂，就处罚杨素蕴，借口回奏“含糊巧饰”，欲给以降职，另调他用的处分。杨一气之下，掷官回了陕西的宜君故乡，“闭门不出”有十余年，直到三桂叛清后，才重新被起用。《清朝先正事略》，卷5，“郝雪海中丞事略·附杨素蕴传”。按：清官方实录在记载此事时，删去了把杨打发回家的史实，惟恐在这个问题上有失世祖的面子。

正处在上升阶段的吴三桂，连朝廷对他也得谦让三分，一般大臣岂能动他一根毫毛！

一方面，三桂将自己意中人从外省调来充实力量；一方面，又把自己的亲信派往其他各省任职。他直接给吏兵两部批文，令某为某地官，授某为某参将、游击，如吏兵两部选用云南、贵州文武官员，与三桂意见不合，必须撤回，只能任命他选用的人，包括选送到外省去，名曰“西选”，即平西王选用的官员。康熙五年十月，兵部不得不向圣祖提出，把选用云贵武职官员的权力交给三桂掌握。兵部抱怨说：当兵部推选出新任命的云贵武官，还未到任，而三桂另已推出人选，以致兵部推选的新官员只好中途返回，造成往返苦累。兵部明知管不了云贵的武职官员的事，干脆不管，便请求“照吏部例”，将此两省武职员缺，“悉听该藩题补”，如无可补之人，由三桂题明，然后兵部给予确认。执掌朝政的四辅臣表示同意，年幼的圣祖皇帝自无疑议。这样，兵部仿效吏部，把它对云南的用人权统统交给了三桂，他可以随心所欲地把自己的人安插到全国各地，所谓“西选之官几满天下”，大概并非是夸张之语。它足以反映三桂权势之大！

三桂还通过垄断地方科举权，把他的藩属子弟选入为官。仅举一例：康熙五年，云南乡试，他的属下中举的达163名。三桂深感满意，不禁自夸：“藩下子弟彬彬多文学之才。”主持考试的官员和地方大吏，皆迎合三桂之意，连那些乳臭未干的少年孩童，“未入棘院”，也把他们的名字列榜署名。《庭闻录》，卷4。这些藩属子弟，在三桂的庇荫下，得以飞黄腾达，无不感恩于三桂，抱以感激之情。在他叛清时，他们都成了他的积极追随者。

出任云贵的总督、巡抚等封疆大吏，一切指令出自朝廷，三桂本不敢过于专擅。但这些大员们都慑于三桂位高权重，无不“改容加礼，惟恐得罪藩府”《四王合传·吴三桂传》，见《荆驼逸史》。。三桂自觉受之无愧，发号施令，他们就惟命是从。他想名正言顺地控制两省的督抚大员，特请命朝廷下令督抚受他“节制”。朝廷毫不迟疑地立即应允。为便于控制，三桂分拨他们的驻地。原先分设贵州总督，驻安顺，云南总督驻曲靖，后合并为云贵总督。康熙五年正月，三桂建议应驻贵阳。《清圣祖实录》，卷18，8页。在此之前，还提出，云南提督移驻云南永昌府，贵州提督移驻安顺府。《清圣祖实录》，卷5，6页。参见《逆臣传·吴三桂传》，卷1。对这些要求，朝廷没加考虑就同意了。

三桂最看重兵权。他征云贵时，世祖授予“大将军印”，执掌征伐大权。按规定，事平后，即应上缴“大将军印”，而三桂迟迟不交。康熙二年（1668年），有一内大臣对留在京师的额驸、三桂的长子吴应熊说：“以前，永历在缅甸，边疆事多，所以才给你父亲将军印，为的是重事权，便于集中号令。如今天下大定，还据有不还，这是为什么？”很明显，内大臣是受辅政大臣的委托，授意应熊作他父亲的工作，赶快把“大将军印”交上来，无论对朝廷，对三桂都可相安无事。这等于给三桂一个面子，免得由皇帝亲自下诏索要“大将军印”，有失三桂的尊严。应熊明白朝廷的意图，及时向他父亲通报情况。三桂不得已，这才上疏，把“大将军印”交回朝廷，心里却闷闷不乐。《庭闻录》，卷4。

吴三桂上缴了“大将军印”，并不意味着他已失去兵权，云贵两省的兵权仍然牢牢地控制在他的手中，而且他还掌握着很有战斗力的数万军队，足以构成一威慑力量。他要巩固住自己的政治地位，惟一的办法是，不断加强自己的军事实力。自从他降清征讨李自成、张献忠农民军、剿灭永历政权，南征北战，已经过去了二十余年。当年跟随他出生入死的一大批将领，有的已经年老，有的战死、病死，有的中途散失，所剩无几。三桂也已是年过半百，接近六十的老人。可以想见，人事沧桑变化之大！三桂当年所依靠的人，转眼之间，都退出了政治与军事舞台。他不能坐视自己的力量的削弱。于是，他开始大量起用诸将的子弟和从四面八方招来的宾客中选择有用人才，加以训练。战争已经结束，不能通过战争来选拔人才，只能靠平时的训练。他以《黄石素书》、《武侯（诸葛亮）阵法》等兵书为教材，让他们学习，掌握军事知识，培养和提高他们的军事素质，“以备将帅之选”，也就是把他们当作将帅的预备军官。三桂的这一做法，对谋取前程的青少年有很大的诱惑力，刺激了他们的热情，他们纷纷报名，踊跃参加训练。“一时少年浮夸之士，人人自以为大将军材也。”《四王合传·吴三桂传》。