凤溪吴氏 原居燕京(今北京)，明代永乐年间吴祥由燕京徒居嘉兴凤喈桥。现今嘉兴郊区凤桥镇一带之吴姓即为其后裔，今存《嘉兴凤溪吴氏宗谱》4册。

秀水吴氏 原居海宁袁花，明代中叶吴昭始迁秀水(今嘉兴)，遂为嘉兴人。明礼部尚书吴随即为其族人。

檇李吴氏 原居安徽休宁，系南宋抗金大将吴玠、吴璘兄弟之后。明代崇帧元年(1628)，吴伯元始迁浙江杭州。崇祯七年再迁居于嘉兴东南之永丰里(今新丰、竹林乡一带)。今存《檇李吴氏族谱》2册。

另一支吴氏由来不详，但世居于嘉兴。清初，洛阳令吴源起即为其族人。今存《嘉兴吴氏家乘》1册(残)。

海宁硖石吴氏 来源有四：一出唐御史中丞吴公约，如明代吴默、清代吴嗣广即其族人。二出宋刺史吴天球，如明代吴遵、清代吴作楫等为其族人。三自海盐澉浦迁来者，如清代吴仪洛、吴应和等即为其族人。四自桐乡洲泉迁来者，如清代吴育行、吴志行兄弟，现代学者吴世昌等均为其族人。今存《硖石吴氏宗谱》2册。

平湖吴氏 源出汝南吴氏，以吴天全为第一世。南宋末，其十八世吴泽自安徽宁国移家于嘉兴思贤乡，宋亡，二十世吴（王贞）义不仕元，治别业于竹庄。至二十三世吴继善于明代洪武初年迁居海盐当湖吴家桥(今平湖胜利乡吴家栅)，至今该地仍为平湖吴氏聚族而居的一个村庄。今存《义门吴氏谱》1册。另外，吴（王贞）之弟吴镇迁居于嘉禾魏塘(今嘉善县魏塘镇)，为元代四大画家之一。

海盐吴氏 先世为浙东天台人，本姓胡。明洪武初，“城澉浦，迁江东故姓实之”，改姓吴居海盐。明代吴中伟、吴麟征即其族人。今存《百步亭吴氏宗谱》3册。