吴姓入闽较集中的主要有五个时期：即西晋“永嘉之乱”、唐代“中原战乱”、北宋“靖康之难”、元代中原板荡、明初经济复苏。

吴姓最早入闽始于汉。据《汉书》载：汉武帝元鼎六年（公元前111年），余善叛乱称帝，汉武帝派横海将军韩说与东越衍侯吴阳，一齐歼灭余善。吴阳被封为外石侯，食邑1000户。外石侯吴阳，应是最早进入福建的吴氏先人之一。据闽清县《龙岗吴氏族谱》记载，入闽始祖吴德兴，于晋永和十年随兄学士吴向协镇越国，遂由江苏入闽，卜居侯官县五都龙坪村。有一支裔孙迁至闽清溪演，成为当地望族。唐、宋及其以后，因随军、任职、战乱、投亲、避祸或逃荒等，入闽的吴氏日益增多，族支繁杂，很难逐一细述。入闽后，其裔孙又辗转移居漳州的，主要有：

莆田沈埔吴祭派

吴祭，字孝先，号道成，河南光州固始善进乡人。唐中和四年（884年），因中原战乱，偕兄弟一行三十余人，往福建侯官避乱，后又迁莆田县北隅，再徙居黄石水南沈埔。吴祭兄弟六人，称入闽六祖。吴祭裔孙分布于莆田、仙游、漳浦、云霄、诏安、东山、平和、龙海及广东等地，为江南一大望族。

象畔吴阙名（进士公）派

吴阙名，唐垂拱进士，吴潜之后裔，唐光启元年（885年），吴潜之五世孙吴尚智，因中原战乱，从河南光州固始携眷随王绪军队入闽，寄迹福州南台，次徙兴化塘下（今莆田黄石）。后吴尚智之子吴阙名（进士公），携眷由兴化黄石塘下移居泉州晋江南关外二十四都龟湖象畔嘉埭拓址，开宗发祥，为入闽吴氏象畔始祖。支分南安、晋江、安溪、云霄、诏安、东山和广东潮阳、普宁等地，蔚成闽南、粤东一大望族。

宁化吴宥派

吴宥，字承顺，宋进士，敕赠文林郎，诰封中宪大夫，吴宣之孙。吴宣，字守德，娶四川节度使孟知祥之女为妻，授吴宣为驸马都尉，封宣城公。后为避祸，吴宣携家人移居江西南丰，生三子：长吴纶、次吴经、三吴绍。吴纶生十子，次子吴宥于北宋天圣五年（1027年），从江西南丰移居福建宁化，为入闽吴氏宁化始祖。吴宥生四子：坎一、坤二、震三、巽四。坤二生三子：泰甫、兴甫、吉甫。吉甫生二子：五四郎、五五郎。五四郎生九子：千一郎、千二郎、千三郎、千四郎、千五郎、千六郎、千七郎、千八郎、千九郎。千九郎生二子：长六四郎、次六五郎。吴宥的裔孙遍布于宁化、长汀、连城、上杭、龙岩、永定、南靖、漳浦、云霄、龙海、诏安及广东梅县、大埔、兴宁等地。被尊为闽粤吴姓客家始祖。

龙岩吴十二郎派

吴十二郎，念一郎之子。南宋时，念一郎因避乱，自河南开封徙居漳州华葑社（今华安县）。子十二郎，于南宋宝祐六年（1258年）迁连城席湖再迁龙岩龙门里儒炉官宅坊，为入闽龙岩始祖。十二郎生子十四郎。十四郎生子三：十六郎、十八郎、二十郎。十六郎生仁甫、天佑、祖受。仁甫居龙岩大池，天佑（玄佐）及祖受之子祖松（肇基）移居南靖。

吴氏四溪吴昭派

祖父吴潜，字毅夫，号履斋，宣州宁国人，宋嘉定十年（1217年）进士，殿试一甲状元，拜右相兼枢密使，因反对赵祺为太子，被贬为广东潮州府任循州安置。宋景定三年（1262年），逝于循州。其子吴极、孙吴昭，迁居福建泉州，运吴潜葬于南安二十八都芹山之湖尾山，面对仙洞山。吴昭生四子，长吴勋，居号龙溪；次吴笃，居号梅溪；三吴然，居号清溪；四吴烈，居号洛溪。故称吴昭为四溪公。衍传南安、晋江、同安、安溪、龙海、云霄等地。