吴承恩墓位于淮安城东南的马甸乡二堡村，在大运河东堤东的南干渠东边。

吴承恩墓园呈方形，四周以小水沟与外界相隔，占地面积约2000平方米。墓基封土直径为5米，高1.5米，墓前竖有1.5米高的石碑，上刻有阴文“荆府纪善吴承恩之墓”10个字。墓南10米有4柱3门带脊檐的牌坊一座。柱高8米，横坊书有楷书“吴承恩之墓”5个字。墓西有古式凉亭一座，四角飞翘，可供游园者小憩。亭之北为甬道，甬道北尽头则为出入墓园之门。

吴承恩墓东北3米处，为其父吴锐之墓。墓园植有蜀松，垂柳数十株。1987年9月与其故居一道被淮阴市人民政府公布为文物保护单位。对外开放10多年来，常有海内外人士和中小学生前去凭吊、瞻仰、祭扫。
1974年12月，吴承恩及其父吴锐之墓同时被盗。由于当时调查人员只见到《先府宾墓志铭》，未能见到吴承恩的棺材，故不知吴承恩的墓已被掘。1981年8月，淮安市人民政府组织专人寻访吴承恩墓地，在马甸乡找到了吴承恩棺材前档板（上刻有吴的官衔“荆府纪善”），于是找到了吴承恩的墓地。当即清理了墓穴，并将以吴墓为中心的一块三亩地征用下来，在四周挖小渠环绕，建为吴承恩墓园。

吴承恩墓的发现

在淮安当地，有很多古墓，而有一些好吃懒做之人常常挖墓掘坟，盗取棺材板和墓中的一些金银财物来卖钱。1975年1月的一天，马甸乡一位小学教师在上班的路上发现了一座被挖的古墓，旁边有两块方形石碑。他当时出于好奇走过去看了看这两块石碑，隐约认出一块上面是用篆字书写的“明吴菊翁之墓”，可见墓主姓吴；另一块则用正楷写的祭文，其中有段文字是：“孤小子成恩”。他眼前一亮，墓主姓吴，而其子名成恩，莫非墓主的儿子是《西游记》的作者吴承恩？于是，他马上向学校汇报了此事，学校非常重视此事，马上又上报给了县文化馆。后经查证，这两块碑正是吴承恩为他的父亲写的墓志铭。大家一阵惊喜，又迅速将此事上报给了南京博物馆。

1981年，淮安县政府派人调查吴承恩的墓地，于是，调查人员先从被盗的“吴菊翁墓”入手，很快找到了当时的盗墓人。他们交代，他们当时在旁边还盗了一个棺材上有“吴”字的墓。
于是调查人员根据线索在一所中学找到了被盗的棺材板，当时棺材板也被木匠改制成了中学的门窗，字迹等都荡然无存，老师们只记得上面有个“吴”字。大家正在失望之时，那个改制棺材板的木匠吴师傅开口了。他说当他改做到棺材横挡板时，发现板上有“荆府纪善射阳吴公灵柩”十个字，这时现场有人开玩笑说：“吴师傅，这具棺材的主人说不准还是你的祖上呢！”吴师傅心里一动，就留下了横板的上半部分，上面刻有“荆府纪善”四个字，“纪善”为明王府的属官，正八品，为明代的独设官职。据考证此墓为明代墓，而明代淮安人只有吴承恩在长兴解任后有“荆府纪善”之补。而且墓主姓吴，号称过“射阳山人”，符合这些条件的明代的淮安人只有吴承恩一人，那么这座墓的主人不是吴承恩还能是谁呢？
后来调查人员在盗墓人的引导下，重新打开了被盗的墓穴，清理出了一男二女共三具骨骼，很明显，这是吴承恩和他的两位夫人。调查人员当即清理了墓穴，并将以吴墓为中心的一块三亩地征用下来，在四周挖小渠环绕，建为吴承恩墓园，供后人凭吊。而那块印有“荆府纪善”四个字的木板，被收藏在吴承恩故居中，它对于学者研究《西游记》的创作时间有着非常重要的意义。