宋元时期，吴姓已遍布全国。上代的一些吴姓大宗仍保持兴盛局面，季扎次子吴征生一支在两宋产生了科举官宦世家吴相家族，濮阳吴氏的一支经辗转迁徙后形成根深叶茂的汝南太原吴氏，渤海吴氏成员南迁江南后落地生根，在两宋时期形成江南第一望族吴宣家族。沉寂上千年之久的吴姓正宗季扎四子吴子玉一支延陵吴氏开始复兴。隐姓达千余年的季扎长房后裔洞庭濮氏于南宋初年复姓归宗。这一时期，由于民族关系问题的存在，宋金长期对峙，产生了影响深远的吴氏军事世家甘肃水洛吴?、吴磷家族。以上吴姓望族都很重视世系传承，其历史渊源十分清晰。

明清时期

    明清时期，吴姓的分布更为广泛，自上古保持世系传承不乱，代有显贵的世家大族几乎绝迹。这时期吴姓望族大都由唐宋时期的单家发展而来，并从地区分布上呈同姓异宗交叉分布，吴姓的迁徙多是由于战乱、灾荒、析居、任官、政府组织移民等诸多原因引起的。例如，明清时期的江西南昌吴氏虽号称诸樊、夫差后裔，但其先祖却是来自安徽歙县的流民，定居南昌后，繁衍成当地大族。江西德兴建节的吴氏则是唐末为避黄巢兵乱而迁来的。江西戈阳吴氏在五代战乱时，从金陵(今南京)迁来的。湖南益吴氏主要有三支，九都冲吴氏其先祖吴世春、吴永鉴叔侄二人自江西清江来湖南益阳经商，从而定居益阳，后裔繁衍成益阳九都冲吴氏。泉峰吴氏，其先祖在元初游学湖南，而定居益阳，后世繁衍成益阳泉峰吴氏。夹流溪吴氏则是明初从江苏、江阴县迁居湖南益阳夹流溪，据其家谱记载，到清乾隆时，这支吴氏已传了13代。

近现代吴氏

在近现代中国历史舞台上最显赫的吴姓人物当属吴佩孚。吴佩孚属登州吴氏。据说吴佩孚曾考证他是延陵吴季扎的裔孙，吴姓开氏始祖吴太伯的第12l代嫡孙。

据《吴氏家谱》记载，登州吴氏来源于泰州吴氏，而泰州吴氏又源于浙江吴田吴氏。吴田吴氏是明代浙江山阴吴氏吴溶、吴渊、吴溥的后裔。据《山阴州山吴氏族谱》记载，这支吴氏的家谱因上世家中失火被烧掉，因而吴田吴氏可确认的始祖为吴回。在历史上，吴田吴氏迁居泰州(今江苏泰州有两支，一支是吴田吴氏第十四世裔孙吴潮先迁泰州而成泰州吴氏始祖，另一支是吴田吴氏五世裔孙吴承护下传12代裔孙吴万四，也自吴田迁至泰州东的安丰。随着泰州吴氏人丁的增多，又有吴潮裔孙吴僧儿吴佩十七世祖自泰州北迁山东蓬莱(古属登州)，其后裔形成登州吴氏。登州吴氏虽然家族不甚显贵，但人丁倒还兴旺。登州吴氏自吴僧儿下传十六世孙吴可诚时，这支吴氏已没落无闻。

迁居台湾

吴姓的发源地江苏南部距离台湾较近，因此吴姓人迁居台湾的历史较早。早在吴国灭亡之时，吴姓子孙有一部分逃亡海上，其中一些人有可能迁到了台湾，然而见于历史记载的却是在元代。

明清以来自福建、广东沿海一带的吴氏迁居台湾的逐渐增多。在台湾的历次统计中，吴姓长期稳坐第七把交椅，这与南明永历年间郑成功渡海收复台湾，从潮州沿海，尤其是饶平、南澳、澄海各县收了不少昊姓士兵有关。在台湾历史人物中，吴姓人占有相当比重，如被称为“阿里山之神”的吴凤，宜兰的开拓者吴沙，抗倭名将吴彭年和吴汤兴，抗日民族英雄吴海水，著名作家吴浊流等都是近现代史上来台的著名吴氏子孙。

远播海外

自公元前473年吴国灭亡至今两千余年，吴姓子孙不仅在祖国内陆往复迁徙，而且还远播国外。早期吴姓主要迁往邻国越南、日本、朝鲜，后来又陆续迁往南洋诸岛繁衍生息。近代由于西方列强入侵，中国国门被打开，中西经济文化的往来加强，一部分吴姓子孙远迁欧美各国。而今随着全球一体化的浪潮，吴姓子孙已遍布全球。

日本

日本与吴国故地隔海相望，国破家亡之后，吴国王室的一些幸存者，到达了日本岛。此后，他们便在这里扎了根。他们给当时落后的日本带来文明的种子，因而不久便建立起威望和地位，成为当地民众的首领。这一批优秀的吴姓族人，在日本备极兴旺。它的一支，演变成日本皇室。

汉、魏至隋唐时，日本吴人怀念故土，倭王曾多次派遣使者朝拜大陆王朝，并郑重表明： 日本王室是吴太伯的后裔。我国的史书《魏略》、《晋书》、《梁书》、《北史》、《路史》，都记载了这类大事。今天的日本皇室，就是吴姓的后代。这一历史事实，引起了中日许多学者史家的浓厚兴趣。元朝初年，中国史官金履祥在他的《通鉴前编》中提到：“日本又云吴太伯之后，盖吴亡其支庶人海为倭。”不久，在海洋彼岸的日本著名僧人中岩园在《日本纪》中也得出了同样的结论。数百年后，到民国初年，吴氏裔孙吴佩孚将军惊奇地发现，他和当时的日本明治天皇同为吴太伯的第101代子孙，大正天皇为102代，裕仁天皇为第103代。时至今日，日本学者鸟越宪三郎、日下恒夫等更推定吴人东渡日本在公元前450年左右，即越灭吴以后。这一批东渡日本的吴姓宗族成员，今天已完全同化和融合到日本民族中，但有的后代数千年来仍保留着自己的血缘标志“吴”，演化成今天日本的“吴”，“吴人”，“吴羽”，“吴服”，“吴汉”，“吴服部”等许多姓氏。如当代日本著名经济学家、日本大学经济学院院长吴文炳博士，日本统计学家、“国势普查之父”吴父聪，都是日本吴姓的佼佼者。但也有一部分东渡日本的吴人，已演变成其他的姓氏，如“松野”等。日本《新撰姓氏录》中记载：“松野，吴王夫差之后，此吴人来我之始也”。