吳姓大宗祠創建於清同治七年(1868年)為當時台灣鎮總兵吳光亮與知府吳本杰會同府城吳姓族人所建，為現址台南市觀亭街52號、座東向西、地倚覆鼎金，前臨德慶溪，乃為”三山來龍”、”眾水聚集”之福地。

　　本祠為吳總兵在南台灣目前僅存的遺跡，為一深具歷史價值之建築物，並於民國八十五年七月內政部公告為第三級古蹟，實值歌功頌德。

　　台南市是先民來台最早開發的地方，也是中原文化在台灣的發源地。現今在台的吳姓族人，大多以泰伯公為共同祭祀之先祖，其父為合稷十四孫古公亶父(周太王)，由此可見吳姓的共同起源，是來自於姬姓，泰伯公世代乃為帝王之家，更有”三讓王”、至德”之美譽。

　　孔子對於泰伯公的三讓之德，倍加讚賞，曾為此贊曰：「泰伯的德行，真可說已到最高境界，三讓天下，簡直無法再用人世間語言來稱頌他了」。孔聖因而美其行曰”至德”，吳氏族人遂有”世界至德宗親總會”之設，也樂以”讓德”為堂號。

　　泰伯公因要讓賢，遠遷於荊蠻，並自號為勾吳，並無任何子嗣，辭世後將王位傳給其弟仲雍，就血綠而言乃由仲雍公一脈衍生而下，故曰泰伯公為吳姓開姓始祖，仲雍公為傳代始祖，到了仲雍十九世孫季札，乃沿襲祖先讓德傳家之風，便尊為”三讓王延陵公”並多用”延陵”、”讓德”做堂號，乃為”繼世始祖”。

　　吳氏得姓至今已有三千餘年，自鄭成功開台以來，以閩粵人士居多，大多以耕農為業，同宗族形成聚落，相協助，甚為團結，是為台灣大望族之一。

　　吳姓族人，渡海來台最早以澎湖為聚居地，其開澎始祖為吳耀餘先生由福建遷至澎湖馬公以拓墾農業，兼做撈魚維生。至於來到台灣本島，始於清康熙末期，至乾隆年間最盛，渡台後散居南北各地。

　　在台南地區，約二十年前，將近有八千戶的吳姓人家，為府城第四大姓，本省的吳姓家族，幾乎有三分之一集中於此地，又以居住於安南區為多。

　　吳氏大宗祠興建年代，眾說紛紜，查內政部（民國八十五年）公告於清同治七年由巡道吳大廷倡建，光緒三年再由台灣總兵吳光亮集全台吳氏捐資續建。

　　另一說法，同治七年由巡道吳大廷，水師協林中營副將吳春坡陸續先後倡建，因相繼離台，宗祠興建之務並未完成，至光緒六年時，再由台灣總兵吳光亮、知府吳本杰二人號召族人出面興建完成，才有今日輝煌之建設，實功不可沒！

　　吳氏大宗祠前臨九米寬觀音亭街，後臨十八公尺寬花園町（公園路）左右南北兩側與民房相鄰接，一帶地勢前後兩邊高起，有如一艘壯觀的船隻聳立於此。自興建後於民國十二年（西元一九二三年）再次捐資重修，歷經多年，宗祠建物漸顯腐朽之態。於民國五十三年九月重修，但期間由於施工工人不慎，引燃大火，將其完全燒燬，只得暫停。隨後於五十五年十一月再重新進行重建事宜並於五十六年五月完成，六十九年再重新粉刷，其景煥然一新。

　　吳氏大宗祠於八十五年七月十六日經內政部列為第三級古蹟，其間又經數年，本祠風華不再，八十七年乃由市府搶修，七月廿二日開工，九月卅日完工。其後再歷經數年，年華漸凋，乃再斥資整修，於九十二年五月開工，九十三年七月竣工。華宇風姿再顯，神采奕奕，象徵著歷代祖先崇高偉大的德性。